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高質量基因組揭示:茶樹起源於中國西南
發佈日期::2020/5/3、瀏覽次數:182

茶樹是重要的經濟作物,是世界上最古老且消費廣泛的飲料,但是關於茶樹的精準基因組一直沒有得到“破解”。


4月27日,《分子植物》在線發表了安徽農業大學宛曉春課題組和韋朝領課題組合作團隊的成果,他們繪製了高質量的茶樹基因組圖譜。


世界主栽茶樹分屬兩個變種——舒茶早(中國種)和阿薩姆種,前者葉小,分佈廣泛,適合製作綠茶等六大茶類;後者葉大,主要分佈在熱帶和冬季溫暖的亞熱帶地區,適合製作紅茶和普洱茶。


在宛曉春和韋朝領合作團隊的研究中,在舒茶早茶樹基因組草圖基礎上,再結合SMRT和Hi-C將其基因組掛載到了15條假染色體上,最終獲得舒茶早茶樹基因組。其中70.38%是LTR逆轉座子,LTR-RTs通過在啟動子區域和內含子中優先插入基因,而這一過程在茶樹基因的基因組大小擴展和轉錄多樣化中起到推動作用。此外,研究發現與茶香氣和抗逆性有關的基因,特別是與萜烯生物合成有關的基因,明顯出現了擴增並形成基因簇。


團隊進一步通過對81種不同起源的茶樹種的序列進行系統進化分析,揭示了3種高度分化的茶樹種群,分別為野生型、阿薩姆型和中國種3類。並且支持了茶樹起源中國西南,並傳播到西亞的路徑。


相關論文信息:https://doi.org/10.1016/j.molp.2020.04.010



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